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- SN/T 4072-2014 梨衰退植原体检疫鉴定方法
标准号:
SN/T 4072-2014
标准名称:
梨衰退植原体检疫鉴定方法
标准类别:
商检行业标准(SN)
出版语种:
简体中文下载格式:
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标准简介:
SN/T 4072-2014.Detection and identification of pear decline Ph ytoplasma.
1范围
SN/T 4072规定了梨衰退植原体的检疫鉴定方法。
SN/T 4072适用于进出境梨树的果苗、组织繁殖材料及媒介昆虫中可能携带梨衰退植原体的检疫鉴定。
2术语与定义
下列术语和定义适用于本文件
2.1聚合酶链式反应polymerase chain reaction;PCR
PCR是在聚合酶的作用下,以DNA为模板,以dNTP为底物,以两条反向的引物对为起点,根据碱基配对原则,按照DNA的核苷酸顺序,合成与模板互补的DNA链的过程,是一种体外基因扩增技术。
2.2DNA阳性对照positive control
以含有梨衰退植原体的DNA提取液或是以携带有梨衰退植原体16SrRNA序列的阳性克隆质粒为模板。
2.3DNA阴性对照negative control 1
以健康的梨树叶脉或枝条韧皮部提取的总DNA为模板
3梨衰退植原体基本信息
梨衰退植原体Pear decline phytoplasma 属于软壁菌门(Tenericutes).软球菌纲(Mollicutes)、菌原体目(Mycoplasmatales)、菌原体科(Mycoplasataceles) K植原体属( Phytoplasma)、苹果畸形组Apple proliferation group(16SrX)。
其他信息参见附录A。
部分标准内容:
SN/T 4072—2014 梨衰退植原体检疫鉴定方法
Detection and identification of pear decline Phytoplasma
国家质量监督检验检疫总局
前言
本标准按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国福建出入境检验检疫局、中华人民共和国内蒙古出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、福建农林大学。
本标准主要起草人:王念武、陈劲松、黄伙水、沈建国、张永宏、翁瑞泉、牟海青、胡方平。
1 范围
本标准规定了梨衰退植原体的检疫鉴定方法。本标准适用于进出境梨树的果苗、组织繁殖材料及媒介昆虫中可能携带梨衰退植原体的检疫鉴定。
2 术语与定义
下列术语和定义适用于本文件
2.1 polymerase chain reaction; PCR
聚合酶链式反应:PCR是在聚合酶的作用下,以DNA为模板,以dNTP为底物,以两条反向的引物对为起点,根据碱基配对原则,按照DNA的核苷酸顺序,合成与模板互补的DNA链的过程,是一种体外基因扩增技术。
2.2 DNA阳性对照 positive control
以含有梨衰退植原体的DNA提取液或是以携带有梨衰退植原体16SrRNA序列的阳性克隆质粒为模板。
2.3 DNA阴性对照 negative control
以健康的梨树叶脉或枝条韧皮部提取的总DNA为模板。
3 梨衰退植原体基本信息
梨衰退植原体 Peardecline phytoplasma 属于软壁菌门(Tenericutes)、软球菌纲(Mollicutes)、菌原体目(Mycoplasmatales)、菌原体科(Mycoplasmatales)、植原体属(Phytoplasma)、苹果畸形组 Apple proliferation group (16SrX)。其他信息参见附录A。
4 方法原理
根据梨衰退植原体的16SrRNA基因碱基序列信息,采用植原体16S-23S rRNA通用引物和梨衰退植原体特异性引物相结合的巢式PCR方法,对该植原体进行鉴定。
5 仪器、用具和试剂
5.1 仪器
PCR仪、高压灭菌锅、制冰机、高速冷冻离心机、离心机、超低温冰箱、常规冰箱、旋涡震荡器、电泳仪、凝胶成像系统、天平(感量:0.001g)、高温干燥箱、生物安全柜、水浴锅等。
5.2 用具
研钵和研棒、可调移液器(2.5μl, 10μl, 20μl, 100μl, 200μl, 1000μl)、枪头(10μl, 200μl, 1000μl)。
5.3 试剂
DNA提取试剂见附录B,巢式PCR检测试剂见附录C。
6 检测鉴定方法
6.1 症状检查
仔细观察梨树的种苗、枝条、叶片等,症状描述参见附录A。
6.2 检疫样品的采集及制备
取有疑似症状的梨树叶、枝条等材料进行实验室检测鉴定;如发现有梨木虱,一并采集送实验室检测鉴定。
6.3 样品DNA提取
将采集的样品(包含梨树枝、叶、梨木虱)进行DNA提取,具体操作见附录B。
6.4 通用引物和特异性引物的巢式PCR扩增、凝胶电泳
梨衰退植原体16SrDNA的扩增使用巢式PCR方法,第一次PCR扩增使用的通用引物为P1/P7,第二次PCR扩增采用的特异性引物为Apf1/rpds1。具体操作见附录C。
7 结果判定
在6.4检测中,通过通用P1/P7及特异性引物Apf1/rpds1两对引物进行巢式PCR扩增,若第一次和第二次扩增产物经凝胶电泳检测结果均为阳性,则判定该样品携带梨衰退植原体;若第一次扩增产物经凝胶电泳检测结果为阴性,第二次扩增产物经凝胶电泳检测结果为阳性,则判定该样品携带梨衰退植原体;其他情况则判定该样品未携带梨衰退植原体。具体的阴性、阳性的判定见附录C。
8 样品保存与复核
8.1 样品保存与处理
样品经登记和经手人签字后妥善保存。对检出的梨衰退植原体样品应保存于-20℃冰箱中,以备复核。该类样品保存期满后应经高压灭菌杀死植原体后方可做丢弃处理。
8.2 结果记录与资料保存
完整的实验记录包括:样品的来源、种类、时间,实验的时间、地点、方法和结果等,并要有实验人员和审核人员签字。PCR凝胶电泳检测需有电泳结果照片。
8.3 复核
由国家质量监督检验检疫总局指定的单位或人员负责。主要考察实验记录、照片等资料的完整性和真实性,必要时进行复核实验。
附录A(资料性附录)
A.1 分类地位
梨衰退植原体相关分类信息。
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