【SN商检标准】 基因条形码筛查方法第9部分:检疫性腥黑粉菌

SN/T 4877.9-2017.DNA barcoding screening method- Part 9 :Quarantine Tilletia.
1范围
SN/T 4877.9规定了小麦印度腥黑穗病菌Tilletiaindica和小麦矮化腥黑穗病菌Tilletia controversa的DNA条形码筛查中序列的扩增分析及结果判定等。
SN/T 4877.9适用于小麦印度腥黑穗病菌和小麦矮化腥黑穗病菌的筛查。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 18085植物检疫小者 矮化腥黑穗病相检疫鉴定方法
GB/T 28080小麦 印度腥黑穗病菌检疫鉴定方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码 DNA barcode
生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。
3.2内部间隔转录区序列internal transcribed space ;ITS
在真核生物中,核糖体DNA是由核糖体基因及有之相邻的间隔区组成,其基因组序列从5'到3'依次为:外部转录间隔区.18 S基因、内部转录间隔区1(IT51).5.8 S基因、内部转录间隔区2(ITS2)、28 S基因和基因间隔序列。内转录闻隔区是存在于18S rDNA、58 S rDNA和28 S rDNA之间的区.域,ITS1和ITS2作为非编码区,受外界环境国素的影响较心r与编码区域相比具有进化速度快的特点，在种内的不同菌株之间高度保守,而在真菌种间存在极大的变化，表现出极大的序列多态性，能够提供详尽的系统学分析所需的可遗传性状。