【SN商检标准】 DNA条形码筛选与质量要求

中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T4625—2016
DNA条形码筛选与质量要求
Principles of screening for DNA barcode quality elements2016-08-23发布
中华人民共和国
国家质量监督检验检疫总局
2017-03-01实施
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
DNA条形码筛选与质量要求
SN/T46252016
中国标准出版社出版
北京市朝阳区和平里西街甲2号（100029）北京市西城区三里河北街16号（100045）总编室：（010)68533533
网址spc.net.cn
中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷*
开本880×12301/16
印张0.5字数10千字
2017年12月第一版
交2017年12月第一次印刷
印数1-500
书号：1550662-32284
定价14.00元
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位：中国检验检疫科学研究院，本标准主要起草人：陈岩、宋云、陈克、赵文军、吴绍强、朱水芳SN/T4625—2016
1范围
DNA条形码筛选与质量要求
本标准规定了我国检疫性有害生物DNA条形码数据的筛选原则与质量要求。SN/T4625-2016
本标准适用于我国检疫性有害生物DNA条形码鉴定系统中的DNA条形码数据。术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。2.1
DNAbarcodes
DNA条形码
-段短的、标准化的基因片段，用于区分不同的物种。该片段在种间存在明显的遗传变异和分化并容易进行PCR扩增。
注：DNA条形码技术主要用于物种识别和新种发现。2.2
凭证标本voucherspecimens
DNA条形码的实物参考凭证。
注：凭证标本信息包括馆藏信息、采集信息、鉴定信息，用于复核。模式标本是用于分类学研究的凭证标本，3DNA条形码筛选原则
3.1物种识别率高，种间具有明显遗传变异和分化，而种内变异较小。3.2引物通用性强，存在保守区，便于设计通用引物。3.3基因片段较短，易于PCR扩增与测序，也易于扩增降解DNA。DNA条形码数据要素
包括物种名称、凭证标本信息、采集记录、鉴定人、DNA条形码、PCR引物和序列峰图7个要素5DNA条形码的样品要求
国际生命条形码协会要求每个物种至少选取10个样品、每种选取5个地理种群，每个种群选取2个个体。每个物种选取1个近缘种（至少2个样品）。6凭证标本要求
凭证标本至少采集3份，用于物种鉴定和国内外标本馆间的交换。主要包括馆藏信息（标本存放地、标本号）、采集信息（采集者、采集日期、采集地点）和鉴定信息（拉丁学名、中文名、鉴定日期、鉴定人）。
rKAoNrKAca
SN/T4625—2016
已有DNA条形码
7.1动物CO1。
7.2植物：rbcL，matK，trnHpsbA，ITS2。7.3真菌：ITS,LSU。
已有DNA条形码部分通用引物
参见附录A。
9新DNA条形码要求
已有DNA条形码在研究类群中无效研究人员收集了大量候选DNA条形码数据。候选DNA条形码能提供足够的变异以识别物种。容易进行PCR扩增。
引物通用性强。
-iTKAoNrKAca
（资料性附录）
已有DNA条形码部分通用引物
已有DNA条形码部分通用引物如表A.1所示。表A.1
DNA条形码
trnH-psbA
LCO1490
HCO2198
rbcLa-F
rbela-R
matK-390F
matK-1326R
ITS-S2F
已有DNA条形码部分通用引物
引物序列（5'-→3'）
GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG
TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA
GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG
TCCTCCGCTTATTGATATGC
ACCCGCTGAACTTAAGC
TCCTGAGGGAAACTTCG
ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGC
GTAAAATCAAGTCCACCRCGbzxZ.net
CGATCTATTCATTCAATATTTC
TCTAGCACACGAAAGTCGAAGT
GTTATGCATGAACGTAATGCTC
CGCGCATGGTGGATTCACAATCC
ATGCGATACTTGGTGTGAAT
TCCTCCGCTTATTGATATGC
退火温度
SN/T4625—2016
应用类群
TrKAoNKAca
SN/T4625—2016
参考文献
[1JTautzD.,ArctanderP.,MinelliA.et al.Aplea forDNAtaxonomy.TRENDSin Ecology andEvolution.2003,18(2):70-74
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L6DataStandardsforBARCODERecordsinINSDC(BRIs).CBOL.[7]Non-COIBarcodeRegions-GuidelinesforCBOLApproval.CBOL.[8] Folmer O,M,Black WH,Lutz R,Vrijenhoek R.DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I from metazoan invertebrates.Molccular Marine Biology and Bio-technology.1994,3：294-299.
书号：155066·2-32284
SN/T4625-2016
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