【SN商检标准】 基因条形码筛查方法第1部分:检疫性棒形杆菌

SN/T 4877.1-2017.DNA barcoding screening method-Part 1 :Quarantine Clavibacter spp.
1范围
SN/T 4877.1规定了检疫性棒形杆菌DNA条形码筛查中序列的扩增、分析及结果判定等。
SN/T 4877.1适用于检疫性棒形杆菌的筛查。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T 1135.5马铃 薯环腐病菌检疫鉴定方法
SN/T2568番茄细菌性溃疡病菌检疫鉴定方法
SN/T 2666苜 蓿细菌性萎蔫病菌检疫鉴定方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码
生物体内能够代表该物种的,标准的.有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。
3.216S rRNA 基因
原核生物核糖体30 S小亚基的组成部分。在细菌的进化过程中,16 S rRNA基因的进化相对保守,被认为是衡量生命进化历史最理想的标尺,基因序列具有高度的保守性和特异性。
16SrRNA基因序列是细菌检测鉴定与分类研究中应用最多的基因序列,是细菌种间鉴定的重要依据。
3.3gyrB基因
编码DNA解旋酶B亚单位的基因,是单拷贝的看家基因,普遍存在于各种细菌中,本部分中gyrB基因序列作为细菌条形码基因进行种及种下阶元的筛查鉴定。