【SN商检标准】 基因条形码筛查方法第4部分:检疫性茎点霉

SN/T 4877.4-2017.DNA barcoding screening method-Part 4:Quarantine Phoma spp.
1范围
SN/T 4877.4规定了检疫性茎点霉DNA条形码筛查方法。
SN/T 4877.4适用于进境植物及其产品中检疫性茎点霉的筛查。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
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3术语 和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码DNA barcode
生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。
3.2内部间隔转录区序列internal tramnscribed spacer;ITS
在真核生物中,核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成,其基因组序列从5'~3'依次为:外部转录间隔区.18 S基因、内部转录间隔区1(ITS1) .5.8 s基因、内部转录间隔区2(ITS2)28S基因和基因间隔序列。内转录间隔区是存在于18 S rDNA、5.8 s rDNA和28 S rDNA之间的区域，ITS1和ITS2作为非编码区,受外界环境因素的影响较小，与编码区域相比具有进化速度快的特点,在种内的不同菌株之间高度保守,而在真菌种间存在极大的变化，表现出极大的序列多态性,能够提供详尽的系统学分析所需的可遗传性状。