【SN商检标准】 基因条形码筛查方法  第7部分:检疫性轮枝菌

SN/T 4877.7-2017.DNA barcoding screening method- Part 7 :Quarantine Verticillium.
1范围
SN/T 4877.7规定了棉花黄萎病菌和苜蓿黄萎病菌DNA条形码筛查中序列的扩增、分析及结果判定等。
SN/T 4877.7适用于检疫性轮枝菌的DNA条形码筛查。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 28084棉花 黄萎病菌检疫检测与鉴定
SN/T 1145苜 蓿黄萎病检疫鉴定方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码DNA barcode
生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。
3.2内部转录间隔区序列internal transcribed spacer;ITS
在真核生物中，核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成,其基因组序列从5'到3’依次为:外部转录间隔区、18 S基因、内部转录间隔区1(ITS1)、5.8 S基因、内部转录间隔区2(ITS2)、28 S基因和基因间隔序列。内转录间隔区是存在于18 S rDNA、5.8 S rDNA和28 S rDNA之间的区域,ITS1和1ITS2作为非编码区.受外界环境因素的影响较小，与编码区域相比具有进化速度快的特点，在种内的不同菌株之间高度保守,而在真菌种间存在极大的变化,表现出极大的序列多态性，能够提供详尽的系统学分析所需的可遗传性状。
4检疫性轮枝菌基本信息
学名:Verticillium dahliae Kleb
中文名:棉花黄萎病菌
学名:Verticillium albo-atrum Reinke et Berthold
中文名:苜蓿黄萎病菌