【SN商检标准】 基因条形码筛查方法第6部分:检疫性嗜酸菌

SN/T 4877.6-2017.DNA barcoding screening method-Part 6 :Quarantine Acidovorax spp.
1范围
SN/T 4877.6规定了Acidovorax citrulli、Acidovorax cattleyae 和Acidovorax konjaci 三种检疫性嗜酸菌的DNA条形码筛查中序列的扩增、分析及结果判定等。
SN/T 4877.6适用于Acidovorax citrulli 、Acidovorax cattleyae 和Acidovorax konjaci三种检疫性嗜酸菌的筛查。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T1465西瓜细菌性果斑病菌检疫鉴定方法
SN/T3681魔芋细菌性叶斑病菌检疫鉴定方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码DNA barcode
生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的.易扩增且相对较短的DNA片段。
3.2内部转录间隔区internal transcribed spacer;ITS
在rDNA基因中,位于保守16S和23S rDNA间隔区之间的序列,包括部分tRNA基因和一些非编码区,由于进化选择压力较小,ITS序列比16S和23S rDNA序列本身的变异性更大,因此,ITS适合用于细菌种下不同群体的特异性检测与鉴定。